ぎょうせい 公用文表記辞書 for ATOKとJust Right!校正項目の「公用文」でのチェックは同じにはなりません。
Just Right!の公用文のチェックの基準は以下になります。

• 送り仮名

  「文部省公用文送り仮名用例集」に基づいて、送り仮名を統一します。
  「文部省公用文送り仮名用例集」に規定されていないものは、本則に統一します。

• 公用文における、漢字や用語の使い方

  昭和56年12月に、文部省が公用文を作るときの参考として配布した「文部省用字用語例」に基づいてチェックします。
  「文部省用字用語例」は、昭和56年10月内閣告示の「公用文における漢字使用等について」に基づいています。

※2010年に改訂された常用漢字表に対応済みです。
（Just Right!4シリーズの場合は、最新のアップデートモジュールを導入してください。）

◆補足

ぎょうせい 公用文表記辞書 for ATOKは、公用文に関する内閣告示・訓令および、ぎょうせい『例解辞典［新版］』に基づいて作成しています。