XHTML ファイルを開く際に、XML 宣言 ( <?xml で始まるタグ) の有無で XHTML の判断をしています。

これは製品の仕様となっています。

XML 宣言 ( <?xml で始まるタグ) がない場合、 XHTML と認識されず xmlns 属性を自動的に削除してしまいます。
記述が変わることで、ブラウザによってレイアウトが崩れたりする場合があります。ご了承ください。