インストール終了後、コンピュータを再起動しても入力メニューの一覧にATOKの入力モード（ひらがな（ATOK）など）が表示されなかったり、［システム設定-キーボード-入力ソース］にATOKを追加しても、 OSの再起動で消えてしまう場合があるという報告を受けています。
本件は、あいにくATOK側で現象の発生を抑制できない、環境固有の様々な要因によるものですが、次の内容を順に行い、改善するか、お試しください。
I ［システム設定］でATOKがオンになっているかどうか
■操作
- アップルメニューから［システム設定］を起動します。
- ［キーボード］を選択し、［テキスト入力］の［入力ソース］で、［編集］をクリックします。
- ［ATOK］が表示されていない場合は、［＋］をクリックします。
- 左の一覧から［日本語］を選択し、右の一覧から［ATOK］を選択して［追加］をクリックします。
※右の一覧に何も表示されていない場合は、［日本語］以外の言語を選択したあと、再度［日本語］を選択してください。
- ［完了］をクリックします。
［閉じる］をクリックして、システム設定を終了します。
◆補足
- システム設定で、すでに［ATOK］が表示されている場合は、［ATOK］を選択して［−］をクリックして一覧から削除してから、コンピュータを再起動し、再度追加します。
- システム設定で［ATOK］が表示されていない場合は、他の言語（Frenchなど）をオンにし、システム設定を終了したあと、再度上記操作を確認してください。
ATOK が表示されない場合は、操作II.を確認してください 。
II ATOKを削除・再インストールしてどうか
具体的な手順については、次のFAQを確認してください。